| 主要的意外與解決方法 |
| 災害名稱 | 內容 | 解決方法 |
| 無法航行 | 耐久力為0，無法行動 | 救助技能、救生工具 |
| 營養不良 | 船員營養不足，忠誠度會下降 不處理會惡化成敗血症 |
食物道具 |
| 壞血病 | 船員因疾病而陸續倒下，沒裝備的裝備品之ㄧ耐久度減1 | 萊姆果汁、部分食物道具、疾病學技能 |
| 衛生不良 | 甲板很髒 沒裝備的裝備品之ㄧ耐久度減1，不處理會惡化成鼠患 |
清潔用甲板長刷 |
| 鼠患 | 出現老鼠 貨物中的食物被吃掉;沒裝備的裝備品之ㄧ耐久度減1 不處理會惡化成瘟疫 |
滅鼠藥、驅除技能 |
| 疫病 | 船員因疾病而陸續倒下 組成艦隊時連艦隊成員的船也會被感染 有裝備的裝備品之ㄧ耐久度減1 |
疾病用特效藥、疾病學技能、副官擺船醫 |
| 爭吵 | 船員彼此打架，忠誠度下降 | 懲罰的繩索、統率技能 |
| 思鄉病 | 船員想家，忠誠度下降 | 望鄉排鐘、各種樂器 |
| 精神不安 | 船員精神不安，忠誠度下降 | 船歌的樂譜、各種樂器 |
| 欲求不滿 | 船員欲求不滿，忠誠度下降 | 消愁酒桶、副官擺船醫 |
| 失眠 | 船員失眠，忠誠度下降 | 安眠吊床 |
| 叛亂 | 船員減少，疲勞度上升 | 統率技能 |
| 火災 | 船隻進水，船身耐久力持續降低，裝有可燃性交易品時 (食品、嗜好品、香辛料、醫藥品、纖維、紡織品、香料、雜貨) 會亂數燒毀其中一種的20%，且沒裝備的裝備品之ㄧ耐久度減1 |
滅火砂、滅火技能、副官防火、擺倉管 |
| 漏水 | 船隻進水，船身耐久力持續降低，速度降低 戰鬥中敵方砲彈命中率上升，且沒裝備的裝備品之ㄧ耐久度減1 |
水桶 |
| 混亂 | 戰鬥中限定，海戰時砲擊命中率降低，肉搏戰時攻擊力、防禦力降低，敵方船隻的攻擊力、防禦力大為提高 | 沉靜的旗幟、統率技能 |
| 嚴重搖晃 | 戰鬥中限定，船員減少1~3名，這損失無法用外科醫術技能及手術用具回復 | 救助 |
| 煙霧 | 戰鬥中限定，海戰時砲擊命中率降低 | 神秘的羽扇 |
| 舵損傷 | 舵受到損傷，轉向速度降低 | 備用船舵 |
| 帆損傷 | 帆受到損傷，航行速度降低 | 備用船帆 |
| 海妖 | 船員跳下海去 | 純棉的耳塞 |
| 海藻 | 船隻速度大為降低，有可能併發舵損傷 | 驅逐技能、副官擺航海長 |
| 磁場異常 | 羅盤無法使用 | 使用測量技能、使用測量儀器(或是立即進港) |
| 暗礁 | 船隻擱淺，船隻耐久力下降 | 避免靠岸行駛 |
| 風暴 | 會因波浪與風而無法進行普通航行，可以下錨減輕傷害 不下錨會發生貨物損失及船隻耐久力與船員減少 |
無 |
| 貨物損失 | 因風暴引起的現象，在無法航行被拖行的時候也會發生，耐久力與船員減少 | 無 |
| 海鷗、海豚 | 不是災害，但卻是海上變化的一種，災害發生率下降 | 海豚回復異常狀態 |
| 大鯊魚 | 小船會少1~3名船員，大船沒影響，但同樣釣不到魚 | 維持在自動航行的狀態下、防範大鯊魚的聖痕 |
| 突風 | 會因強風而突然改變航路或造成速度下降，也可能併發帆損傷 | 副官防風、專用耐風船桅 |
| 大浪 | 因大浪發生進水，最大耐久力有可能下降 | 副官防波、專用耐波裝甲 |
| 橫浪 | 因海浪而突然改變航路，船員落海，也可能併發舵損傷 | 副官防波、專用耐波裝甲 |
| 來路不明的怪物 | 造成船隻及船配件損壞 | 維持在自動航行的狀態下、防範大章魚的聖痕 |
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